作为哺乳动物最大的器官,皮肤是动物与外界环境间最主要的物理屏障;由于生活习性和所处的外界环境不同,皮肤的功能和表面的微生物组成等都会发生变化。同时,皮肤又是独特的免疫器官,在维持稳态和抵抗各种病理条件时,发挥独特的免疫功能。皮肤组织内包含如朗格汉斯细胞、巨噬细胞、树突细胞等多种免疫细胞。在单细胞测序应用领域,研究者往往需要对皮肤组织内的不同细胞亚群进行分类,并在不同疾病模型下定位靶细胞,同时在进行肿瘤类研究时(如黑色素瘤和鳞状细胞癌等)也需要对肿瘤亚型及细胞的识别。
只有制备高质量的单细胞悬液才能保证下游实验的顺利进行,但是常规手工解离皮肤组织,不但费时,且获得的细胞悬液碎片高,产量低,同时还易结团,细胞活性差,严重影响下游研究的开展,如单细胞测序。因此在进行皮肤组织单细胞悬液制备时,需要更加简单快捷的方法,在提高实验效率同时,又能保证实验样本的质量。
瑞沃德单细胞悬液制备仪,通过组织处理管机械剪切,配合酶解试剂盒和内置的处理程序及温控系统,只需将样本放入,设好程序,即可轻松获得高质量皮肤单细胞悬液,获得的细胞可直接用于后续实验,如单细胞测序、原代细胞培养、细胞分选等。
有了高质量的单细胞悬液后,高效稳定且高性价比的单细胞测序平台将保障下游实验结果的质量与大规模应用的可能。达普生物 Galaxy 单细胞建库平台基于专利的微流控油包水单细胞包裹技术与微球编码配套技术,可快速实现 1-4 样本的单细胞测序文库构建。经过生信分析软件 StarScope处理后,表达矩阵结果兼容几乎所有下游生信分析软件,轻松得到单细胞测序实验数据。
下面为大家展示一下,瑞沃德单细胞悬液制备仪和达普生物单细胞建库平台无缝对接的样本制备与单细胞建库测序结果。
样本:小鼠耳部皮肤、背部皮肤。
制备方法:
1. 试剂准备
使用试剂盒中配套的 Buffer 将酶 A、B、C 分别充分溶解。
2. 样本准备
将剪下的小鼠背部皮肤置于冷 PBS 缓冲液中,用手术剪或手术刀的闭合圆边尖端分离皮肤样本后清洗 3 遍;耳部皮肤去除无毛部分,用镊子将背腹侧分开,用镊子轻轻刮耳朵内侧,去除残留软骨,然后将皮肤切成约 1cm2 的组织块。
3. 程序处理
将组织块和酶 mix 放入组织处理管,安装加热套,运行加热程序 “M_Skin_Heater_1”。
4. 单细胞悬液收集
程序运行结束后,用润湿后的 40 μm 细胞滤器过滤细胞悬液样本,50 mL 离心管收集细胞悬液,500 ×g 离心 8min,彻底弃掉上清后,用适当缓冲液重悬后用于单细胞测序、流式细胞术或原代细胞培养等。
达普生物先对上述悬液进行成像质检,并选取背部皮肤组织单细胞悬液,用其自主研发的 Galaxy 单细胞建库平台及配套的转录组试剂盒进行单细胞建库测序。
> 测序结果
1)达普 StarScope 软件分析结果:
2) UMAP 聚类分析:
与发表文献对比,所有细胞类群能够 mapping,比例高度相似,并且线粒体基因百分较低,证实利用达普 Galaxy 对皮肤组织样本单细胞转录组测序的可行性及瑞沃德单细胞悬液制备仪解离的皮肤组织样本可直接对接达普 Galaxy 单细胞建库系统。
以上单细胞转录测序结果显示:通过瑞沃德自动单细胞悬液制备系统制备的皮肤组织样本可以直接用于达普 Galaxy 单细胞建库平台,不但缩短样本悬液制备时间,同时高质量的悬液质量,减少了单细胞建库过程中样本优化及减少一些碎片对反转录的影响,保证了建库质量,整体上缩减了整个单细胞建库测序周期,验证了瑞沃德与达普 Galaxy 产品的高兼容性。
瑞沃德与达普生物在单细胞测序市场的业务上下游互补关系。达普生物在液滴微流控方面积累多年经验,自主研发了高通量单细胞测序系统。自上市以来,获得广大客户的青睐及好评。2023 年新年伊始,达普生物星海单细胞 3' 转录组测序建库试剂盒 V1.0 正式升级为 V2.0 版本,持续为生物医学研究方向提供优质的单细胞测序解决方案。瑞沃德与达普生物双方强强联合,致力于打通单细胞测序上测序仪之前的各环节关卡,保证单细胞测序质量,共同深耕单细胞测序领域。达普生物与瑞沃德双方强强联合,致力于打通单细胞测序上测序仪之前的各环节关卡,保证单细胞测序质量,共同深耕单细胞测序领域。
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